Koottu hydraulijärjestelmä puhdistetaan kierrätysmenetelmällä. Hydraulijärjestelmän säiliöitä ja hydraulipumppuja voidaan käyttää erityisolosuhteiden mukaan, pääsy korkean tarkkuuden öljynsuodattimeen, jolla on suuri likakapasiteetti, mutta niitä voidaan käyttää myös erityisiin puhdistuslaitteisiin.
Puhdistuslaite koostuu hydraulipumpuista, säiliöistä, lämmittimistä ja öljynsuodattimista sekä muista komponenteista. Puhdistuslaitteen öljynsuodattimelta vaaditaan riittävän korkea suodatustarkkuus (3-5μm absoluuttinen tarkkuus) ja lianpitokyky. Kaksipatruunaisia suuritehoisia öljynsuodattimia voidaan käyttää suurissa järjestelmissä suodatinelementtien vaihtamiseen ilman, että puhdistustyöt keskeytyvät.
Monimutkaisissa järjestelmissä ne voidaan jakaa useisiin osiin tai piireihin ja puhdistaa erikseen. Jos osat ovat herkkiä kontaminaatiolle tai joiden nopeus on rajoitettu nestevirtaukseen, nämä osat tulee irrottaa virtapiiristä puhdistusprosessin ajaksi ja kytkeä piiri ohituksella.
Järjestelmän puhdistus tehdään yleensä alhaisen viskositeetin nesteillä ja suurimmalla mahdollisella nesteen virtausnopeudella riittävän turbulenssin ylläpitämiseksi järjestelmäpiireissä.
Puhdistus jossain määrin, irrotetut komponentit, jotka on liitetty järjestelmään, jatka puhdistusta, kunnes järjestelmä öljy täyttää määritetyt vaatimukset.
